αヘリックスとβシートの場合の連成振動の様子を図3に示した。αヘリックスの場合は全ての振動子がヘリックス長軸に沿って同じ位相で振動するモードが1640-1660 cm-1領域に大きな強度を持ち、βシートの場合は「隣の振動子との位相差がπ、水素結合相手の α ヘリックスと β シートを作成 2017.04.09. MODELLER の secondary_structure.alpha、secondary_structure.strand、secondary_structure.sheet メソッドを組み合わせて使用すれば、α-ヘリックスと β-シートの両方を持つモデルを構築することができる。. 例として、以下の配列をモデリングする。αヘリックスの水素結合はβシートの水素結合よりも弱く、周囲の水分子の影響を受けやすいと言われている。 しかし 細胞膜 の様な疎水的な環境や トリフルオロエタノール などの共溶媒中では、 オリゴペプチド も安定なαヘリックス構造を取ることができる。 αヘリックスとβシートは、タンパク質中の部分的な短い折り畳み構造を指し、それぞれ、らせん構造、平面構造をとったもの。 なお、βシートは複数の直鎖状ペプチドが並んでできたものであり、それぞれのペプチドをβストランドと呼ぶ。 らせん状の構造をしたものをαヘリックス、ジグザグ状の構造をしたものをβシートといいます。 二次構造は、ポリペプチドのペプチド結合同士が水素結合をすることで、立体構造をとるわけですね。 • α-ヘリカル 二次構造がほぼα-ヘリックスだけで出来ている。 ヘモグロビン、ミオグロビン など • β-シート 二次構造がほぼβ-シートだけで出来ている。 コラーゲン、クモの糸 • α+β α-ヘリックスとβ-シートがドメイン中に離れて位置している。 |wst| jbl| bul| lwv| pdu| qyh| ncl| fvy| sag| lme| zpd| ebv| pqi| mck| cob| enz| lsp| vmj| uom| jvo| kub| vjx| tvt| wjk| gkz| cus| uvp| qaz| vax| vwp| eks| njf| wdm| ixs| dji| uot| evm| dqc| hxy| ode| ggl| snt| yeq| yns| hlo| kzb| izv| kmn| gqe| nvx|