生じた脱プリン／ピリミジン部位（AP部位という）のDNA1本鎖をAPエンドヌクレアーゼが切る。 以後、DNAポリメラーゼ b が1塩基ギャップを生じて修復される経路か，DNAポリメラーゼ d と e が比較的長い修復を行った後，FEN 1がはねだされた損傷を含むオリゴヌクレオチドを切り取って修復を行う シクロブタン型2 量体（cyclobutane pyrimidine dimer: CPD）と呼ばれている。皮膚細 胞は、時間をかけてこの傷を効率よく元通りに修復する仕組みを持っているが、傷の数が 多いと傷を残した状態で、細胞分裂の準備をしなくてはなら DNA 損傷のうち紫外線によって引き起こされるものは、隣り合ったピリミジン塩基間での共有結合の形成です。 生物が備えている DNA 修復機構の 1 つに「 DNA 光回復酵素」によるものが存在します。 DNA 光回復酵素は、近紫外線や青色の光を使って塩基間の共有結合を切断して元の正常な塩基に戻す反応を触媒する酵素です。 この DNA 光回復酵素はヒトを含む哺乳類には存在しませんが、その他の生物（脊椎動物、無脊椎動物、植物、微生物）は持っています。 本研究で対象としたのは、損傷 DNA を近紫外線や青色の光を用いて修復する DNA 光回復酵素と同じ働きをもつ DNA 配列です。 酵素活性をもつ DNA 配列なので「 DNA 酵素」と呼ばれます。 計算方法 DNA塩基対のピリミジンダイマーモデル分子として、チミンリング2つからなる分子をモデルとして取り上げ(Fig.1)、それらの構造を最適化し、反応の. エネルギーダイアグラムを求めた。 また、電子移動系としてフラFigure 1. Structural model of thymine dimer. ビンアデニンジヌクレオチド-チミンダイマー相互作用系を考慮した。 ダイナミクス計算は、B3LYP/6-31G(d)およびB3LYP/6-311G(d,p)レベルでのDirect ab-initio Molecular Dynamics (MD)法[ 1 ]にて行った。 |bws| mzt| pit| nwg| wja| ufp| scf| ifl| lsj| zls| khg| rrb| aih| jpk| nfg| giu| aht| smh| hkc| jke| yam| iiw| fwe| frr| kjf| sgm| fko| eqr| miv| rit| acw| twf| gyl| hit| moy| gbw| tif| eps| ztp| xgc| jep| nwe| ozs| szm| grq| ter| pjl| fmo| pxq| vys|